单细胞qRT-PCR是在单细胞水平上对基因的表达进行实时定量分析的技术。常规的qRT-PCR所得结果是数以百万计的细胞的平均水平，只能说明基因在一个细胞群中大致的表达情况。

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实时定量荧光PCR（Real-time PCR）通过连续监测PCR指数扩增期间荧光信号的变化来即时测定 特异产物的含量，并据此推断目的基因的初始量。该方法可以检测细胞、组织或微生物中基因表达变化.

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